Duvara Yakın Polimerik Bir Zincirin Hidrofobik Etkileşimler Altında Davranışı

dc.contributor.advisor Erzan, Ayşe tr_TR
dc.contributor.author Önder, Pınar tr_TR
dc.contributor.department Fizik Mühendisliği tr_TR
dc.contributor.department Physics Engineering en_US
dc.date 2002 tr_TR
dc.date.accessioned 2015-05-13T16:09:38Z
dc.date.available 2015-05-13T16:09:38Z
dc.description Tez (Yüksek Lisans) -- İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 2002 tr_TR
dc.description Thesis (M.Sc.) -- İstanbul Technical University, Institute of Science and Technology, 2002 en_US
dc.description.abstract Polar olmayan moleküllerin su içerisindeki davranışları sanki aralarında çekici bir hidrofobik etkileşim varmışcasına gerçekleşir. Bu etkileşim, polar ve polar olmayan moleküllerin tümünün serbest enerjlerinin minimize edilmeye çalışıldığında , entropi teriminin katkısıyla ortaya çıkmaktadır. Bu etkileşimler protein katlanması gibi biyolojik süreçlerde de önemli bir role sahiptir. Polar olmayan moleküllerin hidrofobik bir duvarla sınırlandırılmış bir boyutlu yarım uzayda, bu duvarla etkileşimlerinin, Widom tarafından önerilmiş Potts ve Ising spinleri ile dekore edilmiş bir örgü modelinden yararlanarak transfer matisi yöntemiyle hesapladık. Ortalama alan yaklaştırımı ile polar olmayan moleküllerin kendi aralarındaki etkileşimleri için sıcaklığa bağlı bir etkin potansiyel elde ettik. Bu sayede, bir hidrofobik zincirin, iki boyutta hidrofobik bir duvar civarında, farklı sıcaklıklarda içinde bulunabileceği rejimleri, transfer matrisi yöntemiyle bulduk. Daha sonra Monte Carlo yöntemleri ile elde edilen zincir konfigürasyonları üzerinden kesin sayma yaparak zincirin katlanmışlık derecesi için sonuçlar elde ettik. tr_TR
dc.description.abstract Non-polar molecules placed in water behave as if there were attractive interactions between them, at least within a certain temperature interval. This kind of attractive interaction is called hydrophobic interaction and is entropy driven. Hydrophobic interactions also play a role in biological processes such as protein folding. We have studied the decorated lattice model suggested by Widom and co-workers to mimic the so-called hydrophobic interactions and calculated the effective interaction between non-polar particles and a hydrophobic wall. We use the transfer matrix method and the hydrophobic boundary to calculate the interaction between non-polar molecules and a meanfield approximation to obtain the two-body interaction between the hydrophobic molecules. With the knowledge of these interaction potentials, we studied different regimes of the hydrophobic chain at different temperatures using transfer matrix and partial exact enumeration methods. And then we have found the degree of folding of a polymer using exact enumeration of the possible polymer configurations that were generated by Monte Carlo simulation. en_US
dc.description.degree Yüksek Lisans tr_TR
dc.description.degree M.Sc. en_US
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11527/1465
dc.publisher Fen Bilimleri Enstitüsü tr_TR
dc.publisher Institute of Science and Technology en_US
dc.rights İTÜ tezleri telif hakkı ile korunmaktadır. Bunlar, bu kaynak üzerinden herhangi bir amaçla görüntülenebilir, ancak yazılı izin alınmadan herhangi bir biçimde yeniden oluşturulması veya dağıtılması yasaklanmıştır. tr_TR
dc.rights İTÜ theses are protected by copyright. They may be viewed from this source for any purpose, but reproduction or distribution in any format is prohibited without written permission. en_US
dc.subject Hidrofobik Etkileşimler tr_TR
dc.subject Polimerler tr_TR
dc.subject Ising Model tr_TR
dc.subject Monte Carlo Simülasyonu tr_TR
dc.subject Hydrophobic Interactions en_US
dc.subject Polymers en_US
dc.subject Ising Model en_US
dc.subject Monte Carlo Simulation en_US
dc.title Duvara Yakın Polimerik Bir Zincirin Hidrofobik Etkileşimler Altında Davranışı tr_TR
dc.title.alternative The Behavıor Of A Polymer Chaın Under The Presence Of Hydrophobıc Interactıons en_US
dc.type Thesis en_US
dc.type Tez tr_TR
Dosyalar
Orijinal seri
Şimdi gösteriliyor 1 - 1 / 1
thumbnail.default.alt
Ad:
1614.pdf
Boyut:
700.29 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Açıklama
Lisanslı seri
Şimdi gösteriliyor 1 - 1 / 1
thumbnail.default.placeholder
Ad:
license.txt
Boyut:
3.14 KB
Format:
Plain Text
Açıklama