Rt-pcr Ve Gerçek Zamanlı Pcr Kullanılarak Sıçan Böbrek Dokularında Dusp1 Ve Cxcl2 Genleri Üzerindeki İskemi Reperfüzyon Etkilerinin İncelenmesi

thumbnail.default.alt
Tarih
2009-07-02
Yazarlar
Tekarslan, Şeyma Hande
Süreli Yayın başlığı
Süreli Yayın ISSN
Cilt Başlığı
Yayınevi
Fen Bilimleri Enstitüsü
Institute of Science and Technology
Özet
Bu çalışmada, revers transkriptaz Polimeraz Zincir Reaksiyonu ve Gerçek-Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu metotları kullanılarak sıçan böbrek dokularında iskemi reperfüzyon, iskemi önkoşullaması ve ısı önkoşullamasının DUSP1 ve CXCL2 gen ekspresyonu üzerindeki etkileri araştırılmış ve bu sonuçlar önceki mikroarray verileri ile karşılaştırılmıştır. İskemi önkoşullamasının, CXCL2 ve DUSP1 genlerinin ekspresyonunu arttırdığı görülmüştür. Gerçek-Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu sonuçlarının önceki mikroarray sonuçları ile uyumlu olduğu gözlenmiştir. Göreceli ölçüm değerleri, gerçek zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu sonuçlarında diğer metotlara kıyasla daha yüksektir. Friedman testi, Gerçek-zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu, revers transkriptaz Polimeraz Zincir Reaksiyonu ve mikroarray sonuçlarının birbirinden ciddi ölçüde farklı olmadığını kanıtlamıştır. Bu çalışmada, erken iskemi önkoşullamasının DUSP1 ve CXCL2 genlerinin ekspresyonu üzerine etkisi araştırılmıştır. Geç iskemi önkoşullama etkisinin de araştırılması için yeni deneyler tasarlanabilir.
In this study the effects of ischemia reperfusion, ischemic preconditioning (IP) and heat preconditioning (HP) on DUSP1 and CXCL2 gene expression were investigated in rat kidney tissues using reverse transcriptase PCR and real-time q-PCR methods and the results were compared with previously obtained microarray data. IP was found to increase the expression of CXCL2 and DUSP1 genes. It was observed that Real-time PCR results were in good agreement with the previously obtained microarray results. The ranges of relative quantification values were higher in real-time PCR results. Friedman test proved that the results of real-time PCR, RT-PCR and microarray methods were not significantly different from each other. The early preconditioning effects on DUSP1 and CXCL2 gene expression levels were investigated in this study. New experiments could be designed to investigate late preconditioning effects.
Açıklama
Tez (Yüksek Lisans) -- İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 2009
Thesis (M.Sc.) -- İstanbul Technical University, Institute of Science and Technology, 2009
Anahtar kelimeler
İskemi reperfüzyon, İskemi önkoşullaması, Isı önkoşullaması, Böbrek, DUSP1, CXCL2, Gerçek-Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu, Revers transkriptaz Polimeraz Zincir Reaksiyonu, Ischemia reperfusion, Ischemic preconditioning, Heat preconditioning, Kidney, DUSP1, CXCL2, Real-time PCR, RT-PCR
Alıntı