Multipl Skleroz Hastalığının Farklı Klinik Alttiplerinin Sınıflandırılması

thumbnail.default.placeholder
Tarih
2011-02-22
Yazarlar
Korkmaz, Didem
Süreli Yayın başlığı
Süreli Yayın ISSN
Cilt Başlığı
Yayınevi
Fen Bilimleri Enstitüsü
Institute of Science and Technology
Özet
Bu çalışma TAU, GFAP, NFL ve MOG proteinlerini ve klinik verileri kullanarak Multipl Skleroz(MS)’un farklı klinik alttiplerinin sınıflandırılmasına odaklanmaktadır. Bu çalışma için kullanılan protein verileri, hastaların Beyin Omurilik Sıvısı (BOS) örneklerinden elde edilmiştir. Farklı sınıflandırma yöntemleri kullanılarak, MS’in farklı klinik alttpleri, protein verileri ve klinik verilere göre sınıflandırılmışlardır. Bu çalışma, Klinik İzole Sendrom(CIS) dan MS e geçişi bu verileri kullanarak tahmin eden ilk çalışmadır. CIS ve Kontrol grubu arasındaki sınıflandırma 87.31%±12.02 (AUC: 0.93±0.09) doğrulukla, MS ve CIS arasındaki sınıflandırma 76.51% ±11.15 (AUC: 0.83 ±0.12) doğrulukla, RRMS ve PPMS arasındaki sınıflandırma 95.77% ±6.63 (AUC: 0.97±0.08) doğrulukla, MS ve Kontrol grubu arasındaki sınıflandırma 92.64% ±7.15 (AUC: 0.97±0.06) doğrulukla, CIS grubundan RRMS grubuna geçiş 86.45% ±12.6 (AUC: 0.89±0.19) doğrulukla tahmin edilmiştir. Bu çalışma, MS’in klinik alttiplerinin tanısı ve prognozunu ve farklı alttipler arası geçişi tahmin etmek için protein ve klinik verileri ve bilgisayar destekli sınıflandırma yöntemlerini kullanan ilk çalışmadır.
This study focuses on the classification of different clinical subtypes of MS using TAU,GFAP,NFL and MOG proteins and clinical data. Protein data used in this study are obtained by lumbar puncture. Using different classification methods, different clinical subtypes of multiple sclerosis were classified according to their protein and clinical data patterns. To the best of our knowledge, there are no other studies in the literature that uses these patterns to predict the transition from Clinically Isolated Syndrome (CIS) to Multiple Sclerosis. MS patients, CIS patients, and control group were classified with 71.43%± 10.95 accuracy (AUC: 0.82± 0.12), CIS and control group were classified with accuracy: 87.31%±12.02 (AUC: 0.93±0.09), MS and CIS were clasified with 76.51% ±11.15 (AUC: 0.83 ±0.12) accuracy, RRMS and PPMS were classified with 95.77% ±6.63 accuracy (AUC: 0.97±0.08), MS and control group were classified with 92.64% ±7.15 (AUC: 0.97±0.06) accuracy. Transition from CIS to RRMS was predicted with 86.45% ±12.6 (AUC: 0.89±0.19) accuracy. This is a novel study using computer aided classification methods with protein and clinical data for diagnostic and prognostic purposes in predicting clinical subtypes of MS and predicting transition between subtypes.
Açıklama
Tez (Yüksek Lisans) -- İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 2011
Thesis (M.Sc.) -- İstanbul Technical University, Institute of Science and Technology, 2011
Anahtar kelimeler
Multiple Skleroz, Sınıflandırma, TAU, GFAP, NFL, MOG, Biyobelirteç, Multiple Sclerosis, Classification, TAU, GFAP, NFL, MOG, Biomarker
Alıntı