Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı altında bir lisansüstü programı olup, yüksek lisans ve doktora düzeyinde eğitim vermektedir.
Gözat
Konu "AbrB" ile FBE- Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Lisansüstü Programı'a göz atma
(Fen Bilimleri Enstitüsü, 2011-11-18)
Mutlu, Seval; Yazgan Karataş, Ayten; 417477; Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji; Molecular Biology and Genetics
Basilisin, Bacillus subtilis tarafından sentezlenen, L-alanin ve L-antikapsin’den oluşan bir dipeptit (125 kDa) antibiyotiktir. Yakın zamanda, B. subtilis’in basilisin biyosentezinde bir polisistronik operon ywfBCDEFG ve bitişiğindeki monosistronik gen ywfH in görev aldığı bulunmuştur. Önceden, basilisin biyosentezinin hücre yoğunluğu sinyali döngüsünün kontrolü altında gerçekleştiği gösterilmiştir. Ek olarak, basilisin üretiminin global düzenleyici Spo0A tarafından direk olarak, pozitif yönde düzenlenirken, geçiş evresi düzenleyicileri CodY ve AbrB tarafından direk olarak, negatif yönde düzenlendiği bulunmuştur. Çok yakın zaman içinde bu global düzenleyicilerin bac operonunun ifadesi üzerindeki etkisi ve bu global düzenleyicilerin bac promoter bölgesi ile olan etkileşimleri keşfedilmiştir. AbrB ve CodY proteinleri bac promotörünü doğrudan baskılayan negatif düzenleyicilerken, ComA ve Spo0A, bac operonun geçiş evresinde direk uyarılmasını sağlayan, pozitif yönde hareket eden düzenleyiciler olduğu gösterilmiştirdir. Bir sonraki çalışma olarak, bu çalışmada, ywfH promotörünün ComA, CodY, AbrB, Spo0A, ve DegU global düzenleyiciler için doğrudan hedef olup olmadığını “Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA)” yöntemi kullanarak tanımlanması amaçlanmıştır. Bu amaçla, 414bç DNA parçasını içeren ywfH promotör bölgesi, saflaştırılmış C-ucu His6 kuyruklu ComA, Spo0A, AbrB, CodY ve DegU proteinlerinin çeşitli konsantrasyonları ile inkübe edilmiştir. Bunun dışında, AbrB-CodY, Spo0A-ComA, ComA-ComK ve ComA-DegU’nun eş zamanlı mı veya yarışmacı olarak mı PywfH‘ne bağlandığını belirlemek amacıyla iki düzenleyici proteinin varlığında “jel mobility shift” yöntemi tekrarlanmıştır.