Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11527/14522
Title: İnsan Mcf7 Meme Kanseri Hücre Hattında Bag1 Gen  İfadesindeki Değişimin Etkilerinin Araştırılması
Other Titles: Investigating The Effect Of Altered Bag1   Gene Expression In Human Mcf7 Breast Cancer Cell Line
Authors: Doğanay, Gizem Dinler
Behnoud, Sevil
10072591
Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji
Molecular Biology and Genetics
Keywords: Hsp70/Hsc70  complex
Hsp70/Hsc70  complex
Issue Date: 23-Oct-2015
Publisher: Fen Bilimleri Enstitüsü
Institute of Science And Technology
Abstract: Bcl-2  asosiye  athano  gen  (Bag)  ailesi  (Yunanca  ölüm  karşıtı  athanostan)  proteinleri  anti-apoptotik Bcl-2 proteini ile ko-immunopresipitasyon sonucu bulunmuşlardır. Bag  genleri  evrimsel  o larak  korunmuştur  ve  mayalarda,  bitkilerde  ve  hayvanlarda  homologları  mevcuttur. Bag ailesi üyeleri  iki  farklı  yolla  hücre  homeostazını kontrol  eder: (1) Hem pozitif hem negatif şekilde Hsp70/Hsc70 moleküler şaperon sisteminin  çalışma  döngüsünü  regüle  ederek  hücrenin  yaşamsal  faaliyetlerini  normal  ve  stres  koşullarında sürdürmesine katkıda bulunur. Buna spesifik bir örnek, hücrenin normal  ve stres halleri arasındaki dengesinin yönünün Bag -1’e Hsp70 ya da Raf-1’in yarışmalı  bağlanması  sonucu  sağlanması  ile  verilebilir.  (2)  Apoptoz,  tümör  oluşumu,  nöronal  farklılaşma ve hücre döngüsü gibi birçok fizyolojik süreci kontrol eden transkripsiyon  faktörleri  ve  reseptörler  ile  Hsp70/Hsc70  sisteminden  bağımsız  olarak  kompleksler  oluşturur.  Bag  ailesi  üyelerinin,  insanlarda,  kanser,  AIDS  ve  Parkinson  gibi  kompleks  hastalıklarda  normal  hücrelere  kıyasla  ekspresyon  düzeylerinde  ve  hücre  içi  lokalizasyonlarında değişiklikler gözlenmektedir. Dolayısıyla, bu tip hastalıkları tahlil  etmede Bag proteinlerinin hücre içi ekspresyonlarını ve lokalizasyonlarını incelemeye  yönelik  çalışmalardan  yararlanılabilir.  Örneğin,  kanserli  meme  hücrelerinde  yapılan  çalışmalarla  Bag-1  ekspresyonunun,  hastalığın  seyrinin  izlenmesinde  prognostik  bir  markör olarak kullanılabileceği gösterilmiştir. Hücrelerde  Bag-1  izoformlarinin  ekspresyon  düzeyleri  farklılık  göstermektedir.  Bu  izoformlar  hücrelerde  bulunma  sıklıklarına  göre  Bag -1S,  Bag-1L  ve  Bag-1M  olarak  sıralanabilir. Buna rağmen tümörlü hücrelerde ekspresyon düzeyi en yüksek olan Bag -1L  izoformudur.  Bunun  nedeni  ise  Bag-1L’nin  nüklear  lokalizasyonuna  bağlı  olarak  transkripsiyon  faktörlerinin  aktivitesini  yönlendirmesi  ve  böylece  hücre  proliferasyonunu dolaylı yoldan  tetiklemesi  olabilir.  Bag-1  izoformlarinin  hücrelerde  daha  önce  yapılmış  çalışmalar  sonucu  belirlenmiş etkileşim partnerleri; Bcl-2, Raf-1, Hsc70/Hsp70 sistemi, nükleer hormon reseptörleri (NHR), ubikuitin/proteozom mekanizması ve DNA'dır.  Bu  etkileşimlerle  Bag-1  izoformları,  hücre  büyümesi  için  kritik  sinyal  iletimi,  proliferasyon,  transkripsiyon  gibi  hücresel  mekanizmalardan,  hücre  hareketi  ve  apoptoza varana kadar normal, malignan ve stres altında bulunan hücreler için önemli  kontrol yolaklarında görev lmaktadır.
Bcl-2  associated  athanogene  family  (athano  =  against  death  in  Greek)  proteins  are  discovered  by  co-immunoprecipitation  with  Bcl-2  anti-apoptotic  protein.  Bag  genes  are evolutionally conserved and their homologues exist in yeasts, plants and animals.  Bag  family  members  control  the  cell  homeostais  in  two  different  ways:  (1)  They  contribute  to  maintain  cell’s  vital  activity  under  normal  and  stress  conditio ns  via  regulating  both  positively  and  negatively  the  cycle  of  Hsp70/Hsc70  molecular  chaperone  system.  As  a  specific  example,  the  direction  of  the  cell  balance  under  normal and stress conditions are maintained by competitive binding of Hsp70 or Raf-1  to  Bag-1.  (2)  They  form  complexes  with  transcription  factors  and  nuclear  hormone  receptors  which  are  controlling  various  physiological  processes  such  as  apoptosis,  tumorigenesis,  neural  differentiation  and  cell  cycle  independent  from  Hsp70/Hsc70  system.  Expression  levels  and  intracellular  localization  of  Bag-1  family  members  differ  in  human  in  some  complex  diseases  such  as  AIDS  and  Parkinson  Disease  in  comparison with normal cells. For instance, the studies on breast cancer cells showed  that  Bag-1  expression  can  be  used  as  a  prognostic  marker  to  monitor  the  disease  progression.    Recently, it is postulated that high Bag-1 expression is also a prognostic  marker for colon cancer.  Bag-1 isoforms appear to be differently localized in the cells.  Main  Bag-1  isoforms  which  are  observed  in  humans  are  Bag-1S  (36  kDa),  Bag-1M  (46  kDa)  and  Bag-1L  (50  kDa).  There  is  also  another  isoform  of  Bag-1,  29  kDa,  however, since it is very scarce in the cell and thus is not consistently detected. Bag -1  isoforms are produced by alternative translation initiation of single mRNA transcript;  thereby  they  differ  in  their  N-terminus  related  to  translation  initiation.  All  of  Bag -1  isoforms  commonly  include  ubiquitin-like  domain  (ULD)  and  Bag  domain  (BD)  in  their  C-terminus.  Even  though  ULD  doma in  function  is  not  known  clearly  its  evolutional conservation and relations with proteosom machinary indicates that ULD  is necessary for stress tolerance. Bag-1L is localized in nucleus by means of its nuclear  localization signal (NLS). NLS does not exist  in Bag-1M which is cytosolic but can be  translocated  to  nucleus  via  only  companion  proteins  and  Bag -1S  which  always  presents  in  cytosol.  N-terminus  of  Bag-1L  and  Bag-1M  consist  of  eight  TXSEEX  repeats. It is shown that these repeats  have a role  in DNA  bind ing  and transcription  activation depending on their nuclear localizations. Having less repeat sequences, Bag -1S is the shortest isoform in the cells. Bag-1 has  many critical roles  in the cell through its  interactions with certain target  molecules  to  regulate  carcinogenesis,  differentiation,  motility,  proliferation,  cell  survival, apoptosis and transcription. Nuclear hormone receptors, Siah, CHIP, HGF  receptor,  Hsp70/Hsc70  complex,  Bcl-2,  and  C-Raf  (Raf-1)  are  known  interacting  partners of Bag-1.
Description: Tez (Yüksek Lisans) -- İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 2015
Thesis (M.Sc.) -- İstanbul Technical University, Institute of Science and Technology, 2015
URI: http://hdl.handle.net/11527/14522
Appears in Collections:Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Lisansüstü Programı - Yüksek Lisans

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
10072591.pdf1.81 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.